Acinetobacter baumannii (Acb) é uma das principais bactérias associadas às infecções relacionadas à assistência à saúde, com potencial para aquisição de genes de resistência aos antimicrobianos. Durante a pandemia de COVID-19, houve aumento das taxas de isolamento de Acb, e detecção de isolados do clone IC2/CC2, que apresenta grande sucesso evolutivo e adaptativo, antes não circulante no Brasil.

O objetivo deste trabalho é reportar a emergência de uma linhagem de Acb do clone IC2/CC2 co-produtor de OXA-23:NDM-1:ArmA em um hospital público de São Paulo, SP.

Rotineiramente, os isolados recebidos no Instituto Adolfo Lutz são identificados por MALDI-TOF, e submetidos a PCR para identificação do complexo clonal, pesquisa de genes de resistência aos carbapenêmicos (OXAs, KPC e NDM) e análise do perfil clonal por tipagem molecular (PFGE). Para este estudo, um isolado representativo foi selecionado para teste de sensibilidade aos antimicrobianos e sequenciamento do genoma total.

Entre 2021 e 2024, 168 isolados foram recebidos deste hospital, dos quais 52% (88/168) foram identificados como IC2/CC2 produtores de OXA-23. Destes, 19% (17/88) foram co-produtores de NDM. A análise do perfil clonal destes 17 isolados mostrou alta similaridade (> 87%) entre eles. O isolado selecionado para realização do teste de sensibilidade aos antimicrobianos foi classificado como multidroga resistente (MDR). Análises do resistoma demostraram a presença de genes codificadores para carbapenemases (blaOXA-23 e blaNDM-1), para enzimas modificadoras de aminoglicosídeos (aph(6)-Id, aph(3’)-VI) e para a 16S rRNA metiltransferase (armA), que confere alto grau de resistência a aminoglicosideos. O isolado foi tipado como ST218:KL7:OCL1. A filogenia realizada com outros genomas do IC2/CC2 da América do Sul identificou agrupamento com cepas de mesmo ST:KL provenientes tanto do Rio de Janeiro como de São Paulo. A transmissão hospitalar deste clone foi interrompida por meio de medidas educativas com envolvimento dos setores, e reforço a adesão às boas práticas para prevenção de infecção relacionada à assistência, com melhoria dos processos.

Neste estudo, reportamos a emergência e disseminação clonal de Acb IC2/CC2 MDR co-produtor de OXA-23:NDM-1:ArmA em um hospital terciário da cidade de São Paulo, reforçando a necessidade de monitoramento para aplicação de medidas de contenção de um novo patógeno resistente no ambiente hospitalar.