A gravidade da tuberculose depende da interação entre a resposta imune do hospedeiro e a virulência do Mycobacterium tuberculosis (Mtb). Pouco se conhece sobre a associação entre a caracterização genotípica e os aspectos clínicos da doença.

Determinar os fatores de virulência micobacterianos associados a tuberculose disseminada, extrapulmonar e a forma pulmonar cavitária de isolados de pacientes com tuberculose ativa atendidos no HC-FMUSP de 2014 a 2020.

Análise de amostras de conveniência de isolados de Mtb de pacientes com diagnóstico de tuberculose ativa. Os prontuários clínicos foram consultados para avaliar os dados demográficos, clínicos e desfecho. Os isolados de Mtb foram sequenciadas pela plataforma Ion Torrent. A árvore filogenética baseada nos polimorfismos de nucleotídeo único do coregenoma foi construida com o método de máxima virossimilhança pelo programa REALPHY. Além disso, os linhagens e sublinhagens dos isolados foram determinados utilizando TB profiler. A presença dos genes de virulência foi avaliada através do programa Virulence Factor Database (VFDB) e confirmada por curadoria manual. Os genes com variabilidade > 5% foram incluidas na análise bivariada com qui quadrado para avaliar a associação com a forma disseminada, acometimento extrapulmonar e pulmonar cavitária.

No total, 141 isolados clínicos de Mtb foram sequenciados, 65% foram de pacientes de sexo masculino, a mediana de idade foi de 44 anos e 36% (n = 50) foram imunocomprometidos. A forma pulmonar localizada foi a mais comum (65%, n = 91), seguida da forma disseminada (26%, n = 37) e extrapulmonar localizada (9%, n = 13). A maioria dos isolados pertenceram a linhagem euroamericana (99%, n = 140), predominantemente da sublinhagem LAM. Na árvore filogenêtica, não evidenciamos cluster de acordo com as formas clinicas avaliadas. Foram analisados 69 genes de virulência, 84% (n = 58) foram constitucionais do Mtb por estar presentes em 100% das amostras. Cinco genes mbtB, EspB, PPE, espK e plcD tiveram variabilidade > 5% entre as amostras. Não observamos associação entre os genes avaliados e a presença de tuberculose com acometimento extrapulmonar, forma disseminada ou pulmonar cavitária.

Não encontramos associação entre os genes de virulência analizados e a gravidade da tuberculose. A avaliação do genoma completo de Mtb pode completar a presente análise.